Le grand orgue qui se situe en tribune au fond de la nef, au-dessus du portail ouest, est un instrument construit entre 1736 et 1740 par Christophe Moucherel, déjà célèbre à l'époque pour un chef-d’œuvre semblable réalisé à la cathédrale Sainte Cécile d’Albi, tout juste terminée.
De 2001 à 2005, Jean Daldosso de Gimont (Gers), a effectué un remarquable travail de restauration de la partie instrumentale et du buffet, qui a retrouvé sa polychromie d’origine. La mécanique, la soufflerie et la tuyauterie ont été entièrement restaurées dans leur état de 1875.
L’église Saint-Vincent a ainsi recouvré un orgue exceptionnel, tant par ses sonorités que par sa valeur historique.