En 1724 arrivait à Verchères le curé Bouffandeau, premier curé résident. Ce dernier s’occupa de faire construire une église en remplacement de la chapelle. L’église de 1724 fut construite sous le modèle de l’église de Repentigny à l’emplacement du presbytère actuel.
Le financement de cette nouvelle église est d’abord réparti entre tous les habitants, puis des offrandes ou promesses d’argent seront faites. Toutefois, les dons ne suffiront pas à mener à bien la construction, si bien que les habitants doivent contribuer en fournissant des planches et des madriers. Chaque propriétaire de terre devait, sous le même principe que la dîme, fournir une quantité de matériaux déterminée proportionnellement à la taille de sa propriété.
Puis, avec le temps, la population de Verchères s’agrandit. Si bien qu’en 1788, soit 64 ans plus tard, le nouveau curé de l’époque décide d’ériger une nouvelle église, celle-ci à l’emplacement exact de l’église actuelle. Malheureusement le 1er novembre 1818, un orage violent éclate. La foudre frappe le clocher et provoque un incendie majeur. Les paroissiens se rassemblent et réussissent à sauver tous les accessoires qui se trouvent à l’intérieur de l’église: peintures, chaire, tabernacles et autels avant que la propagation des flammes atteigne le cœur et la voûte.
Suite au sinistre, une importante restauration des lieux est entamée. On réutilise les murs d’origine et l’on fait appel à Louis-Amable Quévillon qui avait réalisé les magnifiques ornements sculptés (de 1800 à 1817) avant l’incendie. Il restaure les œuvres abîmées et réalise de tout nouveaux tableaux sculptés. Encore aujourd’hui, on peut admirer ses œuvres uniques au sein de notre église.
Plus tard, encore l’église subit plusieurs améliorations et changements successifs. D’abord, un jubé est aménagé pour recevoir le tout premier orgue en 1831. Ensuite, en 1875, des jubés latéraux sont ajoutés. Puis, en 1894, un nouveau clocher est accolé à une nouvelle façade en pierres de taille. On en profite pour faire bénir les trois cloches : la première se nomme Marie, la deuxième se nomme Joseph et la troisième se nomme François-Xavier. C’est finalement en 1921 que l’église est électrifiée.
Saviez-vous que jusqu’en 1895, tout le terrain à l’arrière de l’église était occupé par le cimetière? Cette année-là, il fut complètement désaffecté. Au cours des trois années précédentes, les corps avaient été graduellement transférés vers le cimetière actuel, situé à quelque 500 m de l’église. C’est en 1892 que le nouveau cimetière, lui, avait été inauguré.
Fait intéressant, l’église de la Municipalité de Verchères est l’une des rares églises qui possèdent toujours son charnier original, celui qui date de la première église de 1788. Soulignons que notre église est également la plus ancienne du Diocèse Saint-Jean–Longueuil. Quelle richesse!