En empruntant le déambulatoire qui entoure le chœur de l'église, le visiteur parcourt aussi une partie de l'histoire de la paroisse de Trois-Pistoles.
Le long des murs se déploie une galerie de portraits et de photographies des prêtres qui ont exercé leur ministère ici au fil des générations. Parmi les premiers visages figure celui de Charles Huot, l'un des missionnaires qui desservaient la région et qui visita Trois-Pistoles dès 1813. Quelques années plus tard, lors de l'érection canonique de la paroisse le 9 novembre 1827, Pierre Bourget devient le premier curé résidant.
Au-dessus du chœur se trouve le jubé, souvent appelé le « jubé des sœurs ». Autrefois réservé aux religieuses lors des offices, cet espace offre aujourd'hui un point de vue privilégié sur l'intérieur de l'église. Trois magnifiques vitraux y attirent le regard : saint Joachim, sainte Anne et saint Joseph.
La statue de Saint-Michel est montrée présentement avec l’historique de sa réparation.
On raconte que par une journée de grands vents, le 11 mars 1988, la statue de l’archange St-Michel tombe du haut du clocher heureusement sans blesser personne. En 1997, suite à un don anonyme, cette statue est restaurée en 1997 par monsieur Georges Bellemare de Montréal. C’était originalement une statue du célèbre sculpteur Louis Jobin, né à St-Raymond de Portneuf en 1845 et décédé en 1928. On lui doit les trois statues de bois recouvertes de plomb qui ornaient les clochers.
Étant restaurées, la statue de La Vierge et l’Enfant et celle de Saint-François-Xavier ont repris leur place sur le clocher. Vu son état de détérioration, on a dû faire une reproduction en fibre de verre de celle de Saint-Michel.
Depuis le jubé des sœurs, le regard embrasse l'ensemble de l'église : la nef, les colonnes, le dôme et les œuvres d'art se révèlent sous un angle unique. C'est un lieu privilégié pour admirer toute la richesse architecturale et patrimoniale de Notre-Dame-des-Neiges.