En août 1938, les Soeurs de Sainte-Croix s'établissent à Baie-Comeau avec pour mission d'enseigner à 60 jeunes catholiques, francophones et anglophones. Alors que la ville n'en est qu'à ses débuts, les religieuses doivent d'abord installer leurs classes sur le chantier avant que l'école ne soit construite.
En raison de l'augmentation significative du nombre d'élèves, on a dû agrandir le bâtiment à plusieurs reprises, au fil des années. Aussi, depuis sa construction, l'école a connu plus d'un nom et plus d'un type de clientèle. Encore de nos jours, tel que son nom l'indique, le Baie-Comeau High School demeure le seul établissement scolaire de langue anglaise de la MRC de la Manicouagan, depuis 1982.